Ecco la mitologia indù dietro questo asana:

Secondo la tradizione indiana, gli esseri umani sono sopravvissuti al Diluvio Universale a causa delle gesta nobili di Manu, il padre del genere umano, e, quindi, gli esseri umani sono chiamati manoshya cioè bambini di Manu. Ecco la storia : molto prima del Diluvio Universale, quando Manu stava facendo un offerta rituale al Sole, un piccolo pesce è apparso nella sua pentola di acqua. Con grande sorpresa di Manu, il pesce parlò in lingua umana: 

"Questa pentola  è troppo piccola per me.” Disse il pesce e  allora Manu lo mise  in mare dove potè crescere sino alla sua grandezza naturale. Il pesce prima di andare via disse a Manu: Ben presto, quando l'oceano avvolgerà tutta la terra, io tornerò a salvare te e tutto il resto che ha bisogno di essere restaurato.  

Così Manu dopo aver lasciato libero il pesciolino nell'oceano riempì l'arca con i semi di tutto ciò che esisteva. L'alluvione venne  come previsto. Il pesce mantenne la promessa e si fece vivo e quando Manu lo vide sopraffatto dalla sua dimensione esclamò: "Hail to Matsyendra, Signore del pesce!" .Manu legò l'arca  sul muso del pesce, e il pesce tirò l'arca con Manu  fin su Mandara che è  una vetta dell’Himalaya. Dopo l'alluvione si allontanò, Manu ripiantò tutto, solo in un modo migliore e più consapevole, e il pesce scomparve nelle profondità dell'oceano. 

La vita sulla terra tornò alla normalità. Ma ben presto, il fascino e le tentazioni del mondo, ancora una volta  cominciarono a consumare la vitalità del corpo umano, il vigore dei sensi, e la brillantezza della mente. Vedendo questo, la Madre Divina, Parvati, chiese al marito, Shiva, il Signore degli Yogi, di condividere con lei la conoscenza dello  yoga, che potrebbe salvare le anime che si perdono  nel mondo. In rispetto alla  sua richiesta, Shiva portò  Parvati su un'isola dove impartì  questa preziosa conoscenza in completa privacy. In questo modo  condivise con lei la saggezza di hatha yoga, che funge da base per tutte le altre forme di discipline fisiche, mentali e spirituali della tradizione yoga. 

Dopo che la sessione finì, scoprirono che la loro pratica non era stata  privata come avevano ipotizzato. Erano seduti accanto ad un pesce  che giaceva lì immobile ed enorme come un’ isola. Rendendosi conto che il pesce aveva sentito e completamente assorbito l'intera conoscenza dello Yoga, Shiva riempì le mani con acqua santificata e lo cosparse sul pesce. Immediatamente uno yogi celeste apparì :. era Matsyendra Natha, il primo maestro nella tradizione di hatha yoga dopo Shiva stesso. 

 Se praticato correttamente, Matsyendrasana ci può aiutare a prevedere l'inondazione del desiderio, l'attaccamento, la rabbia, e la paura, e prendere misure per proteggere noi stessi da nemici fisici e psicologici. Può anche aiutare a trapiantare il semi di benessere e ripristinare la bontà della vita.

Nel suo commento al Hatha Yoga Pradipika, Swami Muktibodhananda scrive:

"Praticando Matsyendrasana uno yogi supera tutte le malattie, perché questa postura aiuta l'aspirante a bilanciare i tre umori del corpo - vata, pitta e kapha. Secondo i principi dello yoga e ayurvedici, le malattie sono causate da uno squilibrio di questi tre umori. Il calo della  giovinezza e la vecchiaia prendono il sopravvento, perché le energie di questi tre umori gradualmente si deteriorano. La pratica di Matsyendrasana attiva direttamente la forza vitale alla sua sorgente nel centro dell'ombelico, controllando in tal modo le funzioni di tutti i nostri centri bioenergetici. 

Inoltre, la padronanza di questo asana garantisce l'illuminazione spirituale, perché il suo obiettivo principale è quello di penetrare il centro dell'ombelico, conferire il controllo sul fuoco , e bruciare tutte le impurità fisiche, mentali, e karmiche. 

Così, questi commenti ci dicono che Matsyendrasana può essere una pratica completa.  Possiamo comprendere queste rivendicazioni solo comprendendo l'anatomia sottile del corpo umano, il sistema di nadi, la funzione dei chakra, e, più in particolare, la dinamica del centro dell'ombelico.